Calculadora de frecuencia de recombinación: distancia entre genes en centimorgans
Calcula la frecuencia de recombinación con los conteos de descendencia parental y recombinante, y conviértela en unidades de mapa (cM) con las correcciones de Haldane y Kosambi.
Cómo funciona
FR = recombinantes ÷ total; 1% de FR = 1 cM; Haldane: d = −50 × ln(1 − 2 × FR)
Cuando hay entrecruzamiento entre dos genes ligados se forman gametos recombinantes, y mientras más cerca estén los genes, más raros son. Por eso la frecuencia de recombinación sirve para medir distancias en el mapa genético: 1% de recombinantes equivale a 1 centimorgan (cM). A distancias grandes, las unidades de mapa simples se quedan cortas porque los entrecruzamientos dobles restauran la combinación parental; las funciones de Haldane y de Kosambi lo corrigen (la de Kosambi además toma en cuenta la interferencia).
Ejemplo resuelto
En una cruza de prueba de Drosophila, Sofía cuenta 412 y 396 moscas de los tipos parentales, y 98 y 94 de los recombinantes. Hay 192 recombinantes en 1,000 descendientes, así que FR = 19.2% y la distancia es de unas 19.2 unidades de mapa. Con la corrección de Haldane: −50 × ln(1 − 0.384) = 24.2 cM; con Kosambi, 20.2 cM.
Preguntas frecuentes
¿Por qué la frecuencia de recombinación nunca pasa de 50%?
Los genes no ligados se segregan de forma independiente y dan 50% de recombinantes; más entrecruzamientos no pueden subir esa cifra. Un valor por encima de 50% significa que las clases se etiquetaron mal.
¿Cómo identifico las clases recombinantes?
En una cruza de prueba, los dos fenotipos más frecuentes son los parentales y los dos menos frecuentes son los recombinantes (de entrecruzamiento simple).
¿Qué es un centimorgan?
Es la distancia entre dos genes para la que 1% de los gametos resulta recombinante. En humanos, 1 cM corresponde en promedio a alrededor de un millón de pares de bases.
¿Cuándo conviene usar la corrección de Haldane o la de Kosambi?
Para distancias menores de unos 10 cM casi no cambian el resultado. A distancias mayores, Haldane supone que no hay interferencia y Kosambi sí la considera, por lo que suele ajustarse mejor a datos reales.
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