🧬 Calculadoras de biología

Calcula la actividad enzimática en unidades (µmol de producto por minuto) y la actividad específica por mg de proteína a partir del producto formado, el tiempo y la cantidad de enzima.

Calcula unidades enzimáticas a partir del cambio de absorbancia (ΔA/min, ε, paso óptico y volúmenes) y la actividad específica en U/mg, con las veces de purificación.

Calcula cuántas copias de ADN produce una PCR a partir de las copias iniciales, el número de ciclos y la eficiencia de amplificación, con el factor de amplificación.

Calcula el área basal por hectárea o por acre a partir de los DAP de una o varias parcelas fijas, o de un conteo con prisma o relascopio con cualquier factor de área basal, junto con árboles por hectárea, diámetro medio cuadrático, índice de densidad de Reineke, densidad relativa, clase de existencias, tabla por clase diamétrica y meta de aclareo por lo bajo, por lo alto o por árbol medio.

Calcula el aumento total de un microscopio compuesto multiplicando ocular por objetivo, y el diámetro del campo de visión al cambiar de objetivo.

Convierte tu conteo en cámara de Neubauer (hemocitómetro) en células/mL y células totales, con cualquier tamaño de cuadro, factor de dilución o volúmenes de azul de tripano, viabilidad, error de conteo y un plan de siembra con el volumen a pipetear.

Calcula el crecimiento logístico dN/dt de una población con su tamaño N, la tasa intrínseca r y la capacidad de carga K, y el crecimiento máximo en N = K/2.

Estima el tamaño de una población animal con el método de captura y recaptura, usando el índice de Lincoln-Petersen y el estimador de Chapman, menos sesgado.

Convierte tu análisis de suelo en toneladas de carbono y CO₂e por hectárea con la materia orgánica, la densidad aparente y la profundidad, y compáralo con la meta 4 por 1000.

Estima la riqueza real de especies con tus abundancias o con singletons y doubletons: Chao1 clásico y corregido por sesgo (con el factor (n−1)/n), varianza, intervalo de confianza log-lineal al 95%, ACE, especies no detectadas y cobertura de la muestra (Good y Chao–Jost).

Compara los conteos de tu descendencia con una proporción mendeliana (3:1, 1:2:1, 9:3:3:1, 1:1 o personalizada) y obtén χ², grados de libertad y valor p.

Calcula el cociente respiratorio (CO₂ producido ÷ O₂ consumido), descubre si se están oxidando carbohidratos, grasas o una mezcla y qué porcentaje aporta cada uno.

Calcula cuántos codones y aminoácidos codifica un ARNm a partir de sus nucleótidos, o cuántos nucleótidos necesita una proteína, con o sin codón de terminación.

Calcula el coeficiente de consanguinidad F según el parentesco de los padres, con una lista de ancestros comunes (método de caminos de Wright), con un pedigrí completo o según el tamaño efectivo de la población (Ne).

Predice el coeficiente de extinción molar (ε₂₈₀) de una proteína a partir de su secuencia o de sus triptófanos, tirosinas y cistinas (Pace/ProtParam o Gill y von Hippel), con peso molecular, Abs 0.1%, valores oxidado y reducido, y la concentración a partir de la A280.

Calcula el coeficiente de temperatura Q10 a partir de dos tasas de reacción o metabólicas, o predice la tasa a otra temperatura si ya conoces el Q10.

Convierte la A260 de tu NanoDrop o espectrofotómetro en ng/µL de ADN, ARN u oligo, revisa la pureza 260/280 y 260/230 y calcula cuántos µL tomar para la masa que necesitas.

Convierte la lectura A260 del espectrofotómetro en concentración de ADN o ARN (ng/µL), calcula el rendimiento total y revisa la pureza con la relación A260/A280.

Convierte la absorbancia a 280 nm en concentración de proteína (mg/mL y µM) con ε (0.1%), E1% o ε molar + peso molecular, o con BSA, IgG y lisozima predefinidas, corrigiendo por dilución, paso óptico y línea base, con revisión de pureza A260/A280 y estimación de Warburg-Christian.

Pega una secuencia de ADN o ARN (texto simple o FASTA) y obtén su contenido GC y AT, el conteo de bases, el sesgo GC, tres estimaciones de la temperatura de fusión (Wallace, básica y ajustada por sal), el peso molecular, una revisión del primer y una gráfica de GC por ventanas.

Calcula cuántas bacterias habrá tras un tiempo de crecimiento exponencial a partir de la población inicial, el tiempo de duplicación y el tiempo transcurrido.

Proyecta el crecimiento exponencial de una población a partir de su tamaño inicial, la tasa de crecimiento y el número de periodos, con el aumento total y el tiempo de duplicación.

Modela el crecimiento de una población que se frena al acercarse a la capacidad de carga K con la ecuación logística: tamaño en cualquier tiempo y % del límite.

Cruza dos progenitores para dos genes independientes y obtén la proporción fenotípica, la probabilidad de cada combinación de rasgos y la descendencia esperada.

Cruza dos genotipos para un solo gen y obtén la proporción genotípica y fenotípica, la probabilidad de cada rasgo y cuántos descendientes esperar de cada tipo.

Escribe el genotipo del progenitor (Aa, AaBb, AaBbCc) y obtén la proporción fenotípica de la cruza de prueba con el homocigoto recesivo y los descendientes esperados.

Cruza los genotipos de dos progenitores para un gen y obtén la proporción genotípica, la proporción fenotípica y la probabilidad de cada rasgo en la descendencia.

Usa la relación especies-área S = c·Aᶻ para predecir cuántas especies caben en un hábitat, ajustar z con dos muestreos y estimar las especies que se pierden al reducirse el área.

Convierte el conteo en hemocitómetro en densidad celular (células por mL) y en el total de células del cultivo, con las células contadas, los cuadros y el factor de dilución.

Calcula la densidad de población dividiendo los individuos entre el área, en km², hectáreas, millas cuadradas o acres, y el espacio promedio por individuo.

Calcula cuántas células sembrar por pozo, caja o frasco según células/cm², células por recipiente o % de confluencia, con los volúmenes de suspensión y medio para una mezcla maestra o por pozo, corrección por viabilidad, tabla para todos los formatos y curva de confluencia proyectada.

Calcula cuántos µL de anticuerpo y de buffer necesitas para tu western blot, inmunofluorescencia o citometría, por proporción (1:1000), por concentración (ng/mL a mg/mL) o por cantidad por prueba, con anticuerpo secundario, dilución intermedia y serie de titulación.

Calcula la concentración de cada tubo en una dilución seriada a partir de la concentración inicial, el factor de dilución por paso y el número de pasos.

Calcula la eficiencia de amplificación de cebadores de qPCR a partir de una curva estándar de diluciones o de su pendiente: E = 10^(−1/pendiente) − 1, con R², intercepto y el criterio del 90–110%.

Calcula la eficiencia de transformación de tus células competentes en UFC/µg a partir de las colonias, el ADN usado y la fracción de la recuperación que sembraste.

Arma la curva estándar de BSA con tus absorbancias, obtén el ajuste lineal y el R², y convierte la absorbancia de tus muestras en concentración de proteína con su dilución.

Calcula la tasa metabólica basal con la ecuación alométrica a × masa^b, ajusta el exponente (¾ de Kleiber o ⅔ de superficie) y ve cómo cambia el gasto por kilo.

Calcula el factor de dilución a partir del volumen de muestra y de diluyente, exprésalo como 1:X y obtén la concentración final de tu solución madre diluida.

Calcula cuántos fragmentos produce una digestión con enzimas de restricción en ADN lineal o circular (plásmido), su tamaño promedio y los sitios esperados al azar.

Estima la frecuencia cardiaca en reposo de un mamífero o un ave a partir de su masa corporal con ecuaciones alométricas publicadas (a × M^b), además del tiempo entre latidos, los latidos por día y por año, la frecuencia respiratoria, la masa del corazón, los intervalos del ECG y la vida de mil millones de latidos.

A partir del número de individuos con el rasgo recesivo, calcula q, p y cuántos portadores heterocigotos (Aa) hay en la población según Hardy-Weinberg.

Calcula la frecuencia de recombinación con los conteos de descendencia parental y recombinante, y conviértela en unidades de mapa (cM) con las correcciones de Haldane y Kosambi.

Cuenta los individuos homocigotos y heterocigotos y obtén las frecuencias alélicas p y q, además de las frecuencias genotípicas de la población, paso a paso.

Calcula las frecuencias alélicas p y q a partir de los genotipos observados y compara las frecuencias genotípicas con lo esperado en equilibrio de Hardy-Weinberg.

Elige el porcentaje de agarosa según el tamaño de tus fragmentos de ADN, o fija el tuyo, y obtén los gramos de agarosa, el buffer TAE o TBE, el agua, el colorante, el buffer de corrida y el voltaje para cualquier charola y número de geles.

Elige el porcentaje de acrilamida que separa tu proteína (o dos proteínas) y obtén la receta del gel separador y del concentrador a partir de un stock al 30% o 40%: Tris, SDS, APS, TEMED y agua, con la convención de Sambrook o de Bio-Rad, escalada al número de geles y al tamaño del cassette.

Calcula la fecha probable de parto de una persona, perra, gata, vaca o yegua a partir de la fecha de monta o de la última menstruación y la duración de la gestación.

Elige el genotipo ABO de la mamá y del papá y descubre la probabilidad de que el bebé tenga tipo de sangre A, B, AB u O, con las combinaciones de alelos.

Calcula las frecuencias alélicas (p y q) y genotípicas (AA, Aa, aa) en equilibrio de Hardy-Weinberg a partir de p o de la frecuencia del fenotipo recesivo q².

Calcula la heredabilidad en sentido amplio (H²) y en sentido estricto (h²) a partir de componentes de varianza, o la heredabilidad realizada con la ecuación del criador.

Calcula tu huella de carbono anual en toneladas de CO₂ y cuántos planetas Tierra harían falta si todos vivieran como tú, según auto, luz, vuelos y dieta.

Calcula el índice de masa corporal de un animal con su masa y su longitud del hocico a la base de la cola, la masa por metro y la tendencia de superficie/volumen.

Calcula el índice de área foliar (IAF) a partir de la transmisión de luz bajo el dosel (Beer–Lambert, con un coeficiente de extinción fijo o calculado según el ángulo del sol y de las hojas, y corrección por agrupamiento), del área foliar cosechada o de la masa seca × área foliar específica, o del área foliar por planta × densidad. Muestra la intercepción de luz, el IAF para 95% de intercepción, una curva de intercepción y valores típicos.

Calcula el índice de diversidad de Shannon-Wiener (H), la equitatividad de Pielou y el número efectivo de especies a partir de la abundancia de cada especie.

Calcula el índice de dominancia de Simpson (D), el índice de diversidad (1 − D) y el inverso de Simpson a partir del número de individuos de cada especie.

Calcula el índice mitótico a partir del recuento de células en profase, metafase, anafase, telofase e interfase, y estima cuánto dura cada fase del ciclo celular a partir de la duración total del ciclo.

Calcula la Km y la Vmax de una enzima con dos puntos de concentración de sustrato y velocidad, usando dobles recíprocos (Lineweaver-Burk) y la eficiencia catalítica.

Calcula el potencial de membrana en reposo con las concentraciones de K⁺, Na⁺ y Cl⁻ y sus permeabilidades relativas (ecuación GHK), junto al potencial de Nernst de cada ion.

Usa la primera ley de Fick, velocidad = D × A × ΔC ÷ Δx, para calcular la velocidad de difusión y el flujo de oxígeno, CO₂ o glucosa a través de una membrana según su superficie, la diferencia de concentración y el espesor.

Estima la tasa metabólica basal de un animal con la ley de Kleiber (a × M^0.75) en kcal/día, kJ/día y watts, y compara su gasto por kilo de masa corporal.

Calcula cuántos nanogramos de inserto necesitas para una relación molar inserto:vector dada, según el tamaño de los fragmentos y la masa de vector en tu ligación.

Obtén Km y Vmax a partir de concentraciones de sustrato y velocidades con la gráfica de dobles recíprocos: pendiente, intersecciones, R², kcat y eficiencia catalítica.

Calcula cuántos moles de fotones y cuánta energía luminosa se necesitan para fijar CO₂ en la fotosíntesis, y la glucosa y el oxígeno que se producen.

Prepara un master mix de PCR para cualquier número de reacciones: µL de tampón, dNTP, cebadores, MgCl₂, polimerasa y agua por reacción y para toda la mezcla, con volumen extra por pérdidas de pipeteo.

Calcula la velocidad de una reacción enzimática con la ecuación de Michaelis-Menten a partir de Vmax, la constante Km y la concentración de sustrato, y qué % de Vmax alcanza.

Convierte la masa de soluto, su peso molecular y el volumen de solución en molaridad para medios de cultivo y buffers: resultado en mol/L, mM y µM, más los moles totales.

Estima el tamaño y la densidad de una población con conteos por cuadrante: media por cuadrante, individuos por m², total del área de estudio e intervalo de confianza del 95%.

Calcula el volumen de stock viral para infectar tus células a la MOI que quieres, con el título en UFP/mL, y el porcentaje de células infectadas según Poisson.

Sigue la energía a lo largo de una cadena alimenticia con la regla del 10%: energía en cada nivel trófico, área que necesita un consumidor tope y por qué las cadenas son cortas.

Convierte nanogramos de ADN (plásmido, genómico o amplicón) en número de copias según su longitud, o al revés, para preparar estándares y diluciones de qPCR.

Convierte una lectura de OD600 en células por mL y células totales del cultivo con tu factor de calibración (por ejemplo, 8 × 10⁸ células/mL por unidad de OD en E. coli).

Planea el pase de tus células: con la confluencia actual, el tiempo de duplicación y cuándo las necesitas, obtén la dilución (split) ideal y la confluencia que tendrán.

Calcula el peso molecular de ADN o ARN a partir de su longitud o de la secuencia exacta (ADN de doble cadena, de cadena sencilla o ARN, química del extremo 5′, lineal o circular), con conversiones de masa a pmol y número de copias, molaridad desde ng/µL, composición de bases y el coeficiente de extinción a 260 nm de un oligo.

Estima el peso molecular de una proteína en Da y kDa a partir de su número de aminoácidos y la masa promedio por residuo (unos 110 Da), más el agua terminal.

Calcula el porcentaje de identidad y similitud entre dos secuencias de ADN, ARN o proteína: pega un alineamiento o deja que la herramienta las alinee (Needleman–Wunsch, BLOSUM62), con identidad sobre el alineamiento, las columnas sin huecos o la secuencia más corta, media o más larga, huecos, puntuación, distancia p con corrección de Jukes–Cantor, Kimura o Poisson, transiciones, transversiones y el alineamiento.

Calcula el potencial hídrico de una solución o célula con el potencial de soluto (−iCRT) y el de presión, y averigua hacia qué compartimento se mueve el agua.

Calcula la productividad primaria neta (PPN) con la PPB y la respiración autótrofa, con la PPB y la eficiencia en el uso del carbono, con el cambio de biomasa más la hojarasca, o con el oxígeno de botellas clara y oscura. Da g C/m²/año, materia seca, CO₂ fijado, O₂ liberado, t C/ha, totales por superficie, PNE y el ecosistema más parecido.

Calcula cuántas presas hay por depredador, la proporción depredador : presa, los depredadores por cada 100 presas y qué porcentaje del total son depredadores.

Estima el punto isoeléctrico (pI) de una proteína y su carga neta a pH 7 con el número de residuos ácidos y básicos (Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys y Arg).

Calcula la concentración de ADN o ARN a partir de la A260 y las relaciones de pureza 260/280 y 260/230, con corrección de fondo a 320 nm, paso óptico, dilución, rendimiento, molaridad y copias por µL, una receta de dilución y una revisión de si la muestra está lista para PCR, qPCR, secuenciación, clonación o transfección.

Calcula el área superficial, el volumen y la relación superficie/volumen de una célula esférica o cúbica en micrómetros, con la fórmula 3/r o 6/a explicada.

Calcula cuántas copias y nanogramos de producto de PCR obtienes tras n ciclos a partir de copias o de masa de templado, con la eficiencia, la meseta según producto, primers y dNTP, el ciclo en que aparece la banda, los ciclos para una cantidad objetivo y una tabla ciclo por ciclo.

Predice la ganancia genética con la ecuación del criador R = h²S, a partir del diferencial o de la proporción seleccionada, con la ganancia anual y las generaciones hasta tu meta.

Calcula cuántos µL de agua o tampón TE añadir a un oligo o cebador liofilizado (nmol en la hoja de especificaciones) para un stock de 100 µM, sus ng/µL, µg totales y la dilución de trabajo de 10 µM.

Obtén el reverso complementario, la complementaria o la inversa de ADN o ARN (una secuencia o varios registros FASTA), con códigos IUPAC, salida en ADN o ARN, mayúsculas conservadas y agrupación en bloques o codones, más longitud, conteo de bases, GC, Tm básica y ajustada por sal, peso molecular y detección de palíndromos.

Estima el tamaño en pares de bases de una banda desconocida en un gel de agarosa con dos bandas del marcador de peso molecular y una curva estándar logarítmica.

Calcula el tamaño efectivo de población (Ne) por proporción de sexos o por censos que fluctúan, con la razón Ne/N y la heterocigosidad que se pierde cada generación.

Calcula la tasa de crecimiento de una población con su tamaño inicial, su tamaño final y el tiempo transcurrido: tasa continua r, crecimiento anual efectivo y cambio total.

Calcula el título viral en TCID50/mL a partir de un ensayo de dilución hasta el punto final con los métodos de Spearman–Kärber y Reed–Muench, con el log del título, el punto final del 50% y las UFP/mL estimadas.

Calcula la temperatura de alineamiento (hibridación) de tu PCR a partir de la Tm de los primers directo y reverso, restando unos grados a la Tm más baja.

Calcula el tiempo de duplicación de un cultivo celular a partir del conteo inicial, el conteo final y el tiempo transcurrido, con el número de duplicaciones y la tasa específica.

Calcula el tiempo de duplicación de un cultivo bacteriano a partir de dos lecturas de OD600 y el tiempo entre ellas, con la tasa específica de crecimiento µ.

Calcula en cuánto tiempo se duplica una población con una tasa de crecimiento constante: fórmula discreta, continua y la regla del 70, en años, meses, días u horas.

Calcula el tiempo de generación (duplicación) de un cultivo con la población inicial, la final y el tiempo transcurrido, más el número de generaciones y la constante k.

Calcula la temperatura de fusión (Tm) de un primer o cebador para PCR con la regla de Wallace a partir de sus bases A+T y G+C, junto con su contenido de GC.

Transcribe una hebra molde de ADN a ARNm o calcula la longitud del ARNm, sus codones, los aminoácidos de la proteína y su peso molecular aproximado.

Escala tu mezcla de transfección lipídica a cualquier formato de placa: µg de ADN por pozo, µL de reactivo según la relación reactivo:ADN, medio sin suero y volumen de plásmido.

Calcula las UFC/mL del cultivo original con las colonias contadas, el volumen sembrado y el factor de dilución de la placa. Recuento de viables paso a paso.

Calcula el porcentaje de viabilidad celular con el conteo de vivas y muertas en azul de tripano, con las concentraciones de un contador automático o con un ensayo en placa de MTT, MTS o resazurina, más las células viables y muertas por mL, el total de viables, un intervalo de confianza del 95%, el volumen de siembra y la estadística de las réplicas.

Calcula el grado de marcaje (DOL, relación F/P) de un anticuerpo o proteína marcados con un fluoróforo a partir de la A280 y la absorbancia del colorante, con el factor de corrección y la concentración de proteína.

Resuelve el modelo depredador-presa de Lotka-Volterra: equilibrio de presas y depredadores, periodo del ciclo, tasas de cambio actuales y una simulación año por año.

Calcula la expresión génica relativa a partir de valores Ct de qPCR con el método 2^−ΔΔCt de Livak: ΔCt, ΔΔCt, cambio de expresión (fold change) y log2, con eficiencia de amplificación opcional.

Convierte la masa de tu muestra de ADN (µg o ng) en picomoles y moles a partir de la longitud del fragmento, con su masa molar y el número de moléculas.