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Calculadora de coeficiente de consanguinidad: F por pedigrí o por población

Calcula el coeficiente de consanguinidad F según el parentesco de los padres, con una lista de ancestros comunes (método de caminos de Wright), con un pedigrí completo o según el tamaño efectivo de la población (Ne).

Calcular
Los padres son
Ancestros comunes: uno por línea como nombre: generaciones hasta el padre, generaciones hasta la madre, F del ancestro
Pedigrí: un animal por línea como animal, padre, madre
Camino: individuos en el lazo que pasa por el ancestro común (n)
Coeficiente de consanguinidad del ancestro común (F_A)
Número de caminos (ancestros comunes distintos)
Tamaño efectivo de la población (Ne)
Machos reproductores (0 = usar Ne)
Hembras reproductoras (0 = usar Ne)
Generaciones
Frecuencia de un alelo recesivo de enfermedad
Cargando calculadora…

Cómo funciona

Wright: F = Σ de todos los caminos (½)^(n₁ + n₂ + 1) × (1 + F_A), donde n₁ y n₂ son las generaciones desde el padre y desde la madre hasta el ancestro común · Pedigrí: F = ½ a(padre, madre) con la matriz de parentesco aditivo (método tabular) · Riesgo de un trastorno recesivo = q²(1 − F) + qF · Población: ΔF = 1 ÷ (2 Ne); F_t = 1 − (1 − ΔF)ᵗ · Ne = 4 Nm Nh ÷ (Nm + Nh)

Un individuo es consanguíneo cuando las dos copias de un gen que porta vienen de una misma copia de un ancestro compartido; el coeficiente de consanguinidad F es la probabilidad de esa identidad por descendencia. Sewall Wright demostró que se puede leer en un pedigrí: sigues cada lazo desde un padre hasta el ancestro común y de ahí hasta el otro padre, la probabilidad se reduce a la mitad en cada paso, y se suma un poco más si el ancestro ya era consanguíneo. Aquí puedes elegir un parentesco estándar, anotar cada ancestro común con las generaciones que lo separan del padre y de la madre, o pegar un pedigrí completo (animal, padre, madre): el método tabular encuentra todos los lazos y da también el parentesco entre los padres. En una población entera, F se acumula a un ritmo que depende del número efectivo de reproductores, por eso los rebaños pequeños y las razas cerradas avanzan hacia la homocigosis aunque nadie planee cruzas cercanas. El precio es la depresión endogámica, que crece más o menos en proporción a F.

Ejemplo resuelto

Sofía cría cabras y quiere cruzar dos primos hermanos. Comparten dos abuelos, cada uno a 2 generaciones del padre y 2 de la madre, así que cada lazo tiene 2 + 2 + 1 = 5 individuos y F = 2 × (½)⁵ = 0.0625: una pérdida de heterocigosidad del 6.25% y un riesgo unas 7.2 veces mayor de que nazca una cría afectada por un trastorno recesivo cuyo alelo tiene frecuencia del 1%. Si pega el pedigrí de dos medios hermanos hijos del mismo semental, obtiene F = ½ × 0.25 = 0.125. Un rebaño cerrado con tamaño efectivo de 50 acumula ΔF = 1% por generación y llega a F ≈ 0.0956 en diez generaciones.

Fuentes: Wright, S. (1922) Coefficients of inbreeding and relationship. American Naturalist 56: 330–338

Preguntas frecuentes

¿Cómo se cuenta n en el método de caminos?

Anota a cada individuo del lazo: el padre 1, la cadena hasta el ancestro común, el ancestro y la cadena de bajada hasta el padre 2; la cría no se cuenta. En la lista de ancestros basta con las generaciones: un abuelo común es «2, 2» y los hermanos completos son dos líneas «1, 1».

¿El coeficiente de consanguinidad es lo mismo que el coeficiente de parentesco?

No. El coeficiente de parentesco entre dos individuos es aproximadamente el doble del F de su descendencia: dos hermanos tienen un parentesco de 0.5 y su cría tiene F = 0.25.

¿Qué hace el modo de pedigrí?

Construye la matriz de parentesco aditivo con el método tabular, el mismo cálculo que usan los registros genealógicos de razas. El F del último animal es la mitad del parentesco entre su padre y su madre. Los animales que solo aparecen como progenitores se toman como fundadores no emparentados, así que el resultado depende de cuántas generaciones escribas.

¿Qué valor de F se considera alto?

Como referencia, F por debajo de 0.016 es despreciable, alrededor de 0.0625 (primos hermanos) es moderado y de 0.125 en adelante ya produce depresión endogámica notable en la mayoría de las especies. En ganadería y conservación se procura que el aumento no pase del 1% por generación.

¿Qué es el tamaño efectivo de la población (Ne)?

Es el número de reproductores de una población ideal que perdería diversidad genética al mismo ritmo que la tuya. Suele ser mucho menor que el censo: con 5 machos y 45 hembras, Ne = 4 × 5 × 45 ÷ 50 = 18. Escribe machos y hembras en Más opciones y la calculadora lo obtiene.

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