Calculadora de concentración de ácidos nucleicos: de A260 a ng/µL y volumen a pipetear
Convierte la A260 de tu NanoDrop o espectrofotómetro en ng/µL de ADN, ARN u oligo, revisa la pureza 260/280 y 260/230 y calcula cuántos µL tomar para la masa que necesitas.
Cómo funciona
Concentración (ng/µL) = A260 × factor de conversión (ADN doble cadena 50, ADN cadena sencilla 33, ARN 40) × factor de dilución · pureza = A260 ÷ A280 (≈ 1.8 ADN, ≈ 2.0 ARN) y A260 ÷ A230 (2.0–2.2)
Los ácidos nucleicos absorben la luz ultravioleta sobre todo a 260 nm por sus bases aromáticas. Con un paso óptico de 1 cm, una absorbancia de 1.0 equivale a unos 50 µg/mL de ADN de doble cadena, 40 µg/mL de ARN o 33 µg/mL de ADN de cadena sencilla; la diferencia se debe al apilamiento de bases, que reduce la absorbancia en la doble hélice. Basta multiplicar la lectura por ese factor y por la dilución. Las proteínas absorben a 280 nm y contaminantes como el fenol, la guanidina o el EDTA cerca de 230 nm, así que las relaciones 260/280 y 260/230 sirven como control rápido de pureza. Ojo: la absorbancia no distingue ADN de ARN ni material íntegro de degradado; para eso necesitas un gel o un ensayo fluorométrico.
Ejemplo resuelto
Luis mide en el NanoDrop un ADN de doble cadena sin diluir: A260 = 0.250, así que tiene 0.250 × 50 = 12.5 ng/µL. Con A280 = 0.135, la relación 260/280 es 1.85 (limpia), y con A230 = 0.120 la 260/230 es 2.08 (también limpia). Para poner 500 ng en una ligación necesita 500 ÷ 12.5 = 40.00 µL.
Preguntas frecuentes
¿Por qué el NanoDrop dice que 1.8 es puro, pero mi ARN da 2.0?
El ARN tiene más uracilo y estructura de cadena sencilla, así que el ARN puro ronda 2.0 y el ADN puro 1.8. Un ADN que marca 2.0 suele tener ARN contaminante.
¿La concentración por A260 es confiable en muestras muy diluidas?
Por debajo de unos 2 a 5 ng/µL (A260 menor de 0.05 a 0.1) la lectura está dominada por el ruido y el fondo del buffer. Para concentraciones bajas usa un ensayo fluorescente como PicoGreen o Qubit.
¿Cómo se calcula la concentración de ARN con la A260?
Multiplica la A260 por 40 y por el factor de dilución. Una A260 de 0.250 sin diluir equivale a 10.0 ng/µL de ARN.
¿Cuántos µL de ADN tengo que tomar para tener cierta masa?
Divide los nanogramos que necesitas entre la concentración en ng/µL. Con 12.5 ng/µL y 500 ng necesarios, tomas 40 µL.
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Fórmulas de laboratorio estándar y recetas de libro de texto (convenciones de Sambrook, Bio-Rad y Thermo Fisher). Si tu kit o el manual de tu equipo indican otra cosa, síguelos, y valida con controles: esta herramienta no sustituye la capacitación de laboratorio ni los procedimientos de seguridad.