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Calculadora de error de masa en ppm (espectrometría de masas)

Calcula la exactitud de masa en ppm y mDa entre un m/z medido y uno teórico en espectrometría de masas de alta resolución, con la ventana ± Da para una tolerancia en ppm y si pasa o no.

m/z teórico (exacto)

m/z medido

Tolerancia

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Cómo funciona

error de masa (ppm) = (medido − teórico) ÷ teórico × 10⁶ · error (mDa) = (medido − teórico) × 1,000 · ventana de tolerancia (Da) = teórico × ppm ÷ 10⁶

Los espectrómetros de masas de alta resolución (Orbitrap, FT-ICR, Q-TOF) expresan la exactitud de masa en partes por millón porque el mismo error absoluto importa menos a masas mayores. Comparar el m/z medido con la masa monoisotópica exacta de una fórmula o un péptido propuestos es el primer filtro para identificar un compuesto: los equipos modernos logran habitualmente menos de 3–5 ppm y muchas revistas piden composiciones elementales dentro de 5 ppm. Una tolerancia en ppm también define la ventana de extracción de cromatogramas y de búsqueda en bases de datos.

Ejemplo resuelto

Un ion peptídico con m/z teórico de 524.2648 se mide en 524.2661. El error es 0.0013 Da = +1.30 mDa, y 0.0013 ÷ 524.2648 × 10⁶ = +2.48 ppm: dentro de una tolerancia de ±5 ppm, cuya ventana es de ± 0.00262 Da (524.2622 – 524.2674).

Fuentes: Brenton AG, Godfrey AR. Accurate mass measurement: terminology and treatment of data. J Am Soc Mass Spectrom 2010;21:1821–35 · IUPAC — Definitions of terms relating to mass spectrometry (2013)

Preguntas frecuentes

¿Cómo se calcula el error de masa en ppm?

Resta la masa teórica de la medida, divide entre la masa teórica y multiplica por un millón. Un error de 0.001 Da a m/z 500 son 2 ppm; el mismo error a m/z 1,000 es 1 ppm.

¿Qué exactitud de masa es aceptable?

Para confirmar una fórmula elemental, dentro de ±5 ppm es el estándar habitual de las revistas (algunas piden ±3 ppm). Los Orbitrap y FT-ICR suelen bajar de 1–2 ppm con calibración interna; en proteómica se usan tolerancias de 10–20 ppm para el precursor.

¿Uso ppm o mDa?

Las ppm son relativas y comparables en todo el rango de masas; los mDa son absolutos y a veces se usan para moléculas pequeñas por debajo de m/z 200, donde unos pocos mDa equivalen a muchas ppm.

¿Importa el signo del error?

El signo indica si la medida queda por encima o por debajo. Un signo constante en muchos iones señala una deriva de calibración que puede corregirse con una masa de referencia (lock mass).

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